!# We mark non transmembrane helixes and sheets by small letters 1 M - ! start of chain 1 (I) 2 F h 3 I h 4 N h 5 R h 6 W h 7 L T 8 F S 9 S - 10 T - 11 N - 12 H H 13 K H 14 D H 15 I H 16 G H 17 T H 18 L H 19 Y H 20 L H 21 L H 22 F H 23 G H 24 A H 25 W H 26 A H 27 G H 28 M H 29 V H 30 G H 31 T H 32 A H 33 L H 34 S H 35 L H 36 L H 37 I H 38 R H 39 A H 40 E H 41 L T 42 G S 43 Q S 44 P S 45 G S 46 T - 47 L S 48 L S 49 G - 50 D S 51 D H 52 Q H 53 I H 54 Y H 55 N H 56 V H 57 V H 58 V H 59 T H 60 A H 61 H H 62 A H 63 F H 64 V H 65 M H 66 I H 67 F H 68 F H 69 M H 70 V H 71 M H 72 P H 73 I H 74 M H 75 I H 76 G T 77 G H 78 F H 79 G H 80 N H 81 W H 82 L H 83 V H 84 P H 85 L H 86 M H 87 I T 88 G T 89 A - 90 P S 91 D S 92 M - 93 A S 94 F - 95 P H 96 R H 97 M H 98 N H 99 N H 100 M H 101 S H 102 F H 103 W H 104 L H 105 L H 106 P H 107 P H 108 S H 109 F H 110 L H 111 L H 112 L H 113 L H 114 A H 115 S H 116 S H 117 M H 118 V S 119 E T 120 A T 121 G - 122 A - 123 G - 124 T S 125 G T 126 W T 127 T T 128 V T 129 Y - 130 P T 131 P T 132 L T 133 A T 134 G S 135 N T 136 L T 137 A T 138 H T 139 A T 140 G T 141 A H 142 S H 143 V H 144 D H 145 L H 146 T H 147 I H 148 F H 149 S H 150 L H 151 H H 152 L H 153 A H 154 G H 155 V H 156 S H 157 S H 158 I H 159 L H 160 G H 161 A H 162 I H 163 N H 164 F H 165 I H 166 T H 167 T H 168 I H 169 I H 170 N H 171 M S 172 K S 173 P - 174 P T 175 A T 176 M - 177 S - 178 Q G 179 Y G 180 Q G 181 T S 182 P - 183 L H 184 F H 185 V H 186 W H 187 S H 188 V H 189 M H 190 I H 191 T H 192 A H 193 V H 194 L H 195 L H 196 L H 197 L H 198 S H 199 L H 200 P H 201 V H 202 L H 203 A H 204 A H 205 G H 206 I H 207 T H 208 M H 209 L H 210 L H 211 T H 212 D H 213 R T 214 N T 215 L S 216 N - 217 T - 218 T - 219 F S 220 F S 221 D - 222 P G 223 A G 224 G G 225 G T 226 G - 227 D - 228 P H 229 I H 230 L H 231 Y H 232 Q H 233 H H 234 L H 235 F H 236 W H 237 F H 238 F H 239 G H 240 H H 241 P H 242 E H 243 V H 244 Y H 245 I H 246 L H 247 I H 248 L H 249 P H 250 G H 251 F H 252 G H 253 M H 254 I H 255 S H 256 H H 257 I H 258 V H 259 T H 260 Y H 261 Y H 262 S T 263 G T 264 K - 265 K S 266 E S 267 P - 268 F T 269 G T 270 Y H 271 M H 272 G H 273 M H 274 V H 275 W H 276 A H 277 M H 278 M H 279 S H 280 I H 281 G H 282 F H 283 L H 284 G H 285 F H 286 I H 287 V - 288 W G 289 A G 290 H G 291 H G 292 M - 293 F G 294 T G 295 V G 296 G - 297 M - 298 D - 299 V H 300 D H 301 T H 302 R H 303 A H 304 Y H 305 F H 306 T H 307 S H 308 A H 309 T H 310 M H 311 I H 312 I H 313 A H 314 I H 315 P H 316 T H 317 G H 318 V H 319 K H 320 V H 321 F H 322 S H 323 W H 324 L H 325 A H 326 T H 327 L H 328 H T 329 G B 330 G - 331 N - 332 I - 333 K - 334 W - 335 S - 336 P H 337 A H 338 M H 339 M H 340 W H 341 A H 342 L H 343 G H 344 F H 345 I H 346 F H 347 L H 348 F H 349 T H 350 V H 351 G H 352 G H 353 L H 354 T H 355 G H 356 I H 357 V H 358 L - 359 A T 360 N - 361 S h 362 S h 363 L h 364 D h 365 I h 366 V h 367 L h 368 H T 369 D T 370 T B 371 Y H 372 Y H 373 V H 374 V H 375 A H 376 H H 377 F H 378 H H 379 Y H 380 V H 381 L H 382 S H 383 M H 384 G H 385 A H 386 V H 387 F H 388 A H 389 I H 390 M H 391 G H 392 G H 393 F H 394 V H 395 H H 396 W H 397 F H 398 P H 399 L H 400 F H 401 S - 402 G S 403 Y B 404 T - 405 L - 406 N - 407 D H 408 T H 409 W H 410 A H 411 K H 412 I H 413 H H 414 F H 415 A H 416 I H 417 M H 418 F H 419 V H 420 G H 421 V H 422 N H 423 M H 424 T H 425 F H 426 F H 427 P H 428 Q H 429 H H 430 F H 431 L H 432 G H 433 L H 434 S T 435 G T 436 M - 437 P B 438 R S 439 R S 440 Y - 441 S S 442 D - 443 Y - 444 P - 445 D G 446 A G 447 Y H 448 T H 449 M H 450 W H 451 N H 452 T H 453 I H 454 S H 455 S H 456 M H 457 G H 458 S H 459 F H 460 I H 461 S H 462 L H 463 T H 464 A H 465 V H 466 M H 467 L H 468 M H 469 V H 470 F H 471 I H 472 I H 473 W H 474 E H 475 A H 476 F H 477 A H 478 S H 479 K T 480 R - 481 E B 482 V E 483 L E 484 T E 485 V - 486 D T 487 L T 488 T G 489 T G 490 T G 491 N - 492 L G 493 E G 494 W G 495 L G 496 N G 497 G - 498 C S 499 P S 500 P - 501 P - 502 Y S 503 H S 504 T - 505 F - 506 E S 507 E S 508 P - 509 T - 510 Y E 511 V E 512 N - 513 L B 514 K - ! End of chain 1 1 M - ! start of chain 102 (III) 2 T - 3 H S 4 Q - 5 T - 6 H S 7 A S 8 Y - 9 H - 10 M - 11 V - 12 N - 13 P - 14 S - 15 P S 16 W H 17 P H 18 L H 19 T H 20 G H 21 A H 22 L H 23 S H 24 A H 25 L H 26 L H 27 M H 28 T H 29 S H 30 G H 31 L H 32 T H 33 M H 34 W H 35 F - 36 H - 37 F S 38 N - 39 S - 40 M - 41 T H 42 L H 43 L H 44 M H 45 I H 46 G H 47 L H 48 T H 49 T H 50 N H 51 M H 52 L H 53 T H 54 M H 55 Y H 56 Q H 57 W H 58 W H 59 R H 60 D H 61 V H 62 I H 63 R H 64 E H 65 S H 66 T H 67 F T 68 Q S 69 G - 70 H - 71 H - 72 T - 73 P H 74 A H 75 V H 76 Q H 77 K H 78 G H 79 L H 80 R H 81 Y H 82 G H 83 M H 84 I H 85 L H 86 F H 87 I H 88 I H 89 S H 90 E H 91 V H 92 L H 93 F H 94 F H 95 T H 96 G H 97 F H 98 F H 99 W H 100 A H 101 F H 102 Y H 103 H H 104 S H 105 S H 106 L - 107 A S 108 P - 109 T - 110 P G 111 E G 112 L G 113 G T 114 G S 115 C S 116 W S 117 P S 118 P - 119 T T 120 G T 121 I - 122 H - 123 P - 124 L - 125 N - 126 P T 127 L T 128 E S 129 V H 130 P H 131 L H 132 L H 133 N H 134 T H 135 S H 136 V H 137 L H 138 L H 139 A H 140 S H 141 G H 142 V H 143 S H 144 I H 145 T H 146 W H 147 A H 148 H H 149 H H 150 S H 151 L H 152 M H 153 E T 154 G T 155 D - 156 R H 157 K H 158 H H 159 M H 160 L H 161 Q H 162 A H 163 L H 164 F H 165 I H 166 T H 167 I H 168 T H 169 L H 170 G H 171 V H 172 Y H 173 F H 174 T H 175 L H 176 L H 177 Q H 178 A H 179 S H 180 E H 181 Y H 182 Y H 183 E H 184 A - 185 P S 186 F - 187 T - 188 I T 189 S T 190 D S 191 G H 192 V H 193 Y H 194 G H 195 S H 196 T H 197 F H 198 F H 199 V H 200 A H 201 T H 202 G H 203 F H 204 H H 205 G H 206 L H 207 H H 208 V H 209 I H 210 I H 211 G H 212 S H 213 T H 214 F H 215 L H 216 I H 217 V H 218 C H 219 F H 220 F H 221 R H 222 Q H 223 L H 224 K T 225 F T 226 H - 227 F - 228 T B 229 S T 230 N T 231 H B 232 H - 233 F H 234 G H 235 F H 236 E H 237 A H 238 G H 239 A H 240 W H 241 Y H 242 W H 243 H H 244 F H 245 V H 246 D H 247 V H 248 V H 249 W H 250 L H 251 F H 252 L H 253 Y H 254 V H 255 S H 256 I H 257 Y T 258 W T 259 W T 260 G T 261 S - ! End of chain 102 1 M - ! start of 103 (II) 2 A - 3 Y - 4 P T 5 M T 6 Q - 7 L - 8 G S 9 F - 10 Q - 11 D - 12 A - 13 T S 14 S S 15 P H 16 I H 17 M H 18 E H 19 E H 20 L H 21 L H 22 H H 23 F H 24 H H 25 D H 26 H H 27 T H 28 L H 29 M H 30 I H 31 V H 32 F H 33 L H 34 I H 35 S H 36 S H 37 L H 38 V H 39 L H 40 Y H 41 I H 42 I H 43 S H 44 L H 45 M H 46 L T 47 T T 48 T - 49 K S 50 L - 51 T - 52 H B 53 T - 54 S S 55 T - 56 M - 57 D - 58 A - 59 Q S 60 E H 61 V H 62 E H 63 T H 64 I H 65 W H 66 T H 67 I H 68 L H 69 P H 70 A H 71 I H 72 I H 73 L H 74 I H 75 L H 76 I H 77 A H 78 L H 79 P H 80 S H 81 L H 82 R H 83 I H 84 L H 85 Y H 86 M H 87 M H 88 D S 89 E - 90 I - 91 N - 92 N - 93 P - 94 S S 95 L e 96 T e 97 V e 98 K e 99 T e 100 M e 101 G e 102 H e 103 Q T 104 W T 105 Y e 106 W e 107 S e 108 Y e 109 E e 110 Y e 111 T - 112 D S 113 Y S 114 E S 115 D - 116 L e 117 S e 118 F e 119 D e 120 S e 121 Y - 122 M B 123 I - 124 P - 125 T G 126 S G 127 E G 128 L - 129 K - 130 P T 131 G T 132 E - 133 L - 134 R T 135 L T 136 L T 137 E - 138 V B 139 D S 140 N S 141 R - 142 V e 143 V e 144 L e 145 P e 146 M T 147 E T 148 M S 149 T - 150 I e 151 R e 152 M e 153 L e 154 V e 155 S e 156 S e 157 E S 158 D S 159 V S 160 L - 161 H e 162 S e 163 W e 164 A e 165 V e 166 P G 167 S G 168 L G 169 G T 170 L e 171 K e 172 T e 173 D e 174 A e 175 I - 176 P T 177 G T 178 R - 179 L - 180 N e 181 Q e 182 T e 183 T e 184 L e 185 M - 186 S - 187 S S 188 R S 189 P - 190 G e 191 L e 192 Y e 193 Y e 194 G e 195 Q - 196 C - 197 S - 198 E S 199 I - 200 C - 201 G S 202 S T 203 N T 204 H T 205 S T 206 F S 207 M - 208 P - 209 I e 210 V e 211 L e 212 E e 213 L e 214 V e 215 P - 216 L h 217 K h 218 Y h 219 F h 220 E h 221 K h 222 W h 223 S h 224 A h 225 S h 226 M T 227 L - ! End of chain 103 4 S - ! start of 104 (IV) (AHG missing at top) 5 V - 6 V - 7 K - 8 S h 9 E h 10 D h 11 Y h 12 A h 13 L S 14 P - 15 S - 16 Y - 17 V - 18 D - 19 R B 20 R T 21 D T 22 Y B 23 P - 24 L S 25 P - 26 D S 27 V S 28 A - 29 H S 30 V - 31 K - 32 N - 33 L - 34 S - 35 A h 36 S h 37 Q h 38 K h 39 A h 40 L h 41 K h 42 E h 43 K h 44 E h 45 K T 46 A S 47 S - 48 W G 49 S G 50 S G 51 L S 52 S - 53 I h 54 D h 55 E h 56 K h 57 V h 58 E h 59 L h 60 Y h 61 R h 62 L h 63 K h 64 F - 65 K S 66 E S 67 S - 68 F h 69 A h 70 E h 71 M h 72 N T 73 R - 74 S - 75 T - 76 N S 77 E H 78 W H 79 K H 80 T H 81 V H 82 V H 83 G H 84 A H 85 A H 86 M H 87 F H 88 F H 89 I H 90 G H 91 F H 92 T H 93 A H 94 L H 95 L H 96 L H 97 I H 98 W H 99 E H 100 K H 101 H H 102 Y H 103 V H 104 Y - 105 G - 106 P - 107 I - 108 P - 109 H G 110 T G 111 F G 112 E S 113 E h 114 E h 115 W h 116 V h 117 A h 118 K h 119 Q h 120 T h 121 K h 122 R h 123 M h 124 L h 125 D h 126 M T 127 K T 128 V S 129 A S 130 P T 131 I T 132 Q T 133 G T 134 F S 135 S G 136 A G 137 K G 138 W S 139 D B 140 Y T 141 D T 142 K T 143 N T 144 E B 145 W - 146 K - 147 K - ! End of chain 104 1 S - ! start of 105 (not trans membrane) 2 H - 3 G - 4 S - 5 H - 6 E - 7 T - 8 D h 9 E h 10 E h 11 F h 12 D h 13 A h 14 R h 15 W h 16 V h 17 T h 18 Y h 19 F h 20 N h 21 K - 22 P T 23 P T 24 I - 25 D - 26 A h 27 W h 28 E h 29 L h 30 R h 31 K h 32 G h 33 M h 34 N h 35 T h 36 L h 37 V T 38 G T 39 Y S 40 D S 41 L B 42 V - 43 P - 44 E - 45 P h 46 K h 47 I h 48 I h 49 D h 50 A h 51 A h 52 L h 53 R h 54 A h 55 C h 56 R h 57 R h 58 L T 59 N T 60 D - 61 F h 62 A h 63 S h 64 A h 65 V h 66 R h 67 I h 68 L h 69 E h 70 V h 71 V h 72 K h 73 D h 74 K h 75 A T 76 G T 77 P T 78 H - 79 K T 80 E T 81 I h 82 Y h 83 P h 84 Y h 85 V h 86 I h 87 Q h 88 E h 89 L h 90 R h 91 P h 92 T h 93 L h 94 N h 95 F h 96 L h 97 G T 98 I - 99 S - 100 T - 101 P h 102 E h 103 E h 104 L h 105 G T 106 L T 107 D T 108 K - 109 V - ! End of chain 105 1 A - ! start of 106 (not tm) 2 S - 3 G - 4 G - 5 G - 6 V - 7 P - 8 T - 9 D h 10 E h 11 E h 12 Q h 13 A - 14 T - 15 G h 16 L h 17 E h 18 R h 19 E h 20 V h 21 M h 22 L h 23 A h 24 A h 25 R h 26 K T 27 G T 28 Q - 29 D - 30 P T 31 Y T 32 N - 33 I - 34 L S 35 A - 36 P - 37 K B 38 A - 39 T - 40 S - 41 G - 42 T S 43 K T 44 E T 45 D S 46 P - 47 N e 48 L e 49 V e 50 P e 51 S e 52 I S 53 T S 54 N S 55 K e 56 R e 57 I e 58 V e 59 G e 60 C e 61 I - 62 C - 63 E S 64 E T 65 D T 66 N - 67 S S 68 T - 69 V - 70 I e 71 W e 72 F e 73 W e 74 L e 75 H e 76 K S 77 G S 78 E S 79 A - 80 Q e 81 R e 82 C - 83 P T 84 S T 85 C T 86 G - 87 T - 88 H e 89 Y e 90 K e 91 L e 92 V e 93 P e 94 H - 95 Q S 96 L S 97 A - 98 H - ! 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